Аргинин.Ру - всё об аргинине  
В начало
Контакты
Рекламодателям
 


молекула L-arginine
молекула L-arginine

Нобелевские лауреаты 1998 года:

Ф.Ферчготт

Л.Игнарро

Ф.Мурад

аргинин по 1000 мг 90 капсул производства Solgar

Про аргинин:

Что такое аргинин?
Откуда берется аргинин?
Механизм действия.

Аргинин в медицине:

Сердечная недостаточн.
Стенокардия
Гипертония
Онкология (рак)
Геронтология (старение)
Атеросклероз
Травмы
Ожоги
Гормональный обмен
ВИЧ/СПИД

Где купить аргинин

аргинин по 1000 мг 90 капсул производства Solgar

Библиотека статей:




Deprecated: Methods with the same name as their class will not be constructors in a future version of PHP; SAPE_base has a deprecated constructor in /home/ih72672/public_html/arginine.ru/1152e72650d4093c1a42c7534a7d7797/sape.php on line 21

Deprecated: Methods with the same name as their class will not be constructors in a future version of PHP; SAPE_client has a deprecated constructor in /home/ih72672/public_html/arginine.ru/1152e72650d4093c1a42c7534a7d7797/sape.php on line 615

Deprecated: Methods with the same name as their class will not be constructors in a future version of PHP; SAPE_context has a deprecated constructor in /home/ih72672/public_html/arginine.ru/1152e72650d4093c1a42c7534a7d7797/sape.php on line 1177

Deprecated: Methods with the same name as their class will not be constructors in a future version of PHP; SAPE_articles has a deprecated constructor in /home/ih72672/public_html/arginine.ru/1152e72650d4093c1a42c7534a7d7797/sape.php on line 1529

Warning: Use of undefined constant _SAPE_USER - assumed '_SAPE_USER' (this will throw an Error in a future version of PHP) in /home/ih72672/public_html/arginine.ru/1152e72650d4093c1a42c7534a7d7797/sape.php on line 1090
Авторы: Rispe C, Legeai F, Gauthier JP, Tagu D.
Дата:2007 год, октябрь.

Strong heterogeneity in nucleotidic composition and codon bias in the pea aphid (Acyrthosiphon pisum) shown by EST-based coding genome reconstruction.

  автоматический перевод
The aim of this study was to analyze patterns of nucleotidic composition and codon usage in the pea aphid genome (Acyrthosiphon pisum). A collection of 60,000 expressed sequence tags (ESTs) in the pea aphid has been used to automatically reconstruct 5809 coding sequences (CDSs), based on similarity with known proteins and on coding style recognition. Reconstructions were manually checked for ribosomal proteins, leading to tentatively reconstruct the nea-complete set of this category. Pea aphid coding sequences showed a shift toward AT (especially at the third codon position) compared to drosophila homologues. Genes with a putative high level of expression (ribosomal and other genes with high EST support) remained more GC3-rich and had a distinct codon usage from bulk sequences: they exhibited a preference for C-ending codons and CGT (for arginine), which thus appeared optimal for translation. However, the discrimination was not as strong as in drosophila, suggesting a reduced degree of translational selection. The space of variation in codon usage for A. pisum appeared to be larger than in drosophila, with a substantial fraction of genes that remained GC3-rich. Some of those (in particular some structural proteins) also showed high levels of codon bias and a very strong preference for C-ending codons, which could be explained either by strong translational selection or by other mechanisms. Finally, genomic traces were analyzed to build 206 fragments containing a full CDS, which allowed studying the correlations between GC contents of coding and those of noncoding (flanking and introns) sequences.   Цель данного исследования заключается в том, чтобы анализировать модели nucleotidic состав и codon использования в горошину тля генома (Acyrthosiphon pisum). Коллекция 60000 выражена последовательностью тегов (ЭБТ) в горошину тля был использован для автоматического восстановления 5809 кодирования последовательностей (CDSs), на основе схожести с известными белками и стиль оформления признания. Реконструкции были вручную проверены на ribosomal белков, что приводит к предварительно реконструировать АЯЭ-комплект этой категории. Пеа тля кодирования последовательностей показал переход к АТ (особенно на третьей позиции codon) по сравнению с дрозофил гомологов. Гены с putative высокий уровень выражения (ribosomal и других генов с высоким EST поддержка) остается более GC3 богатых и отдельной codon использования от основной последовательности: они экспонируются в пользу C-окончание codons и ВКТ (для аргинина), который Таким образом, представляется оптимальным для перевода. Тем не менее, дискриминация была не столь сильна, как в дрозофил, предложив меньшей степени трансляционного отбора. Космические вариации в codon использования для А. pisum-видимому, больше, чем в дрозофил, причем значительная часть генов, которые остались GC3 богатых. Некоторые из них (в частности, некоторые структурные белки), также показали высокий уровень codon предвзятости и очень сильное предпочтение C-окончание codons, которое может быть объяснено либо сильным трансляционного отбора или с помощью других механизмов. Наконец, геномных следы были проанализированы построить 206 фрагментов, содержащих полный CDS, который позволил изучения корреляции между содержанием GC кодирования, а также noncoding (фланкирующими и интроны) последовательностей.

к списку статей за 2007 год (en)

в библиотеку