Аргинин.Ру - всё об аргинине  
В начало
Контакты
Рекламодателям
 


молекула L-arginine
молекула L-arginine

Нобелевские лауреаты 1998 года:

Ф.Ферчготт

Л.Игнарро

Ф.Мурад

аргинин по 1000 мг 90 капсул производства Solgar

Про аргинин:

Что такое аргинин?
Откуда берется аргинин?
Механизм действия.

Аргинин в медицине:

Сердечная недостаточн.
Стенокардия
Гипертония
Онкология (рак)
Геронтология (старение)
Атеросклероз
Травмы
Ожоги
Гормональный обмен
ВИЧ/СПИД

Где купить аргинин

аргинин по 1000 мг 90 капсул производства Solgar

Библиотека статей:




Deprecated: Methods with the same name as their class will not be constructors in a future version of PHP; SAPE_base has a deprecated constructor in /home/ih72672/public_html/arginine.ru/1152e72650d4093c1a42c7534a7d7797/sape.php on line 21

Deprecated: Methods with the same name as their class will not be constructors in a future version of PHP; SAPE_client has a deprecated constructor in /home/ih72672/public_html/arginine.ru/1152e72650d4093c1a42c7534a7d7797/sape.php on line 615

Deprecated: Methods with the same name as their class will not be constructors in a future version of PHP; SAPE_context has a deprecated constructor in /home/ih72672/public_html/arginine.ru/1152e72650d4093c1a42c7534a7d7797/sape.php on line 1177

Deprecated: Methods with the same name as their class will not be constructors in a future version of PHP; SAPE_articles has a deprecated constructor in /home/ih72672/public_html/arginine.ru/1152e72650d4093c1a42c7534a7d7797/sape.php on line 1529

Warning: Use of undefined constant _SAPE_USER - assumed '_SAPE_USER' (this will throw an Error in a future version of PHP) in /home/ih72672/public_html/arginine.ru/1152e72650d4093c1a42c7534a7d7797/sape.php on line 1090
Авторы: Reid GE, Roberts KD, Kapp EA, Simpson RI.
Дата:2004 год, август.

Statistical and mechanistic approaches to understanding the gas-phase fragmentation behavior of methionine sulfoxide containing peptides.

  автоматический перевод
Recently, we carried out a statistical analysis of a 'tryptic' peptide tandem mass spectrometry database in order to identify sequence-dependent patterns for the gas-phase fragmentation behavior of protonated peptide ions, and to improve the models for peptide fragmentation currently incorporated into peptide sequencing and database search algorithms [Kapp, E. A., Schutz, F., Reid, G. E., Eddes, J. S., Moritz, R. L., O'Hair, R. A. J., Speed, T. P. and Simpson, R. J. Anal. Chem. 2003, 75, 6251-6264.]. Here, we have reexamined this database in order to determine the effect of a common post-translational or process induced modification, methionine oxidation, on the appearance and relative abundances of the product ions formed by low energy collision induced dissociation of peptide ions containing this modification. The results from this study indicate that the structurally diagnostic neutral loss of methane sulfenic acid (CH3SOH, 64Da) from the side chain of methionine sulfoxide residues is the dominant fragmentation process for methionine sulfoxide containing peptide ions under conditions of low proton mobility, i.e., when ionizing proton(s) are sequestered at strongly basic amino acids such as arginine, lysine or histidine. The product ion abundances resulting from this neutral loss were found to be approximately 2-fold greater than those resulting from the cleavage C-terminal to aspartic acid, which has previously been shown to be enhanced under the same conditions. In close agreement with these statistical trends, experimental and theoretical studies, employing synthetic "tryptic" peptides and model methionine sulfoxide containing peptide ions, have determined that the mechanism for enhanced methionine sulfoxide side chain cleavage proceeds primarily via a 'charge remote' process. However, the mechanism for dissociation of the side chain for these ions was observed to change as a function of proton mobility. Finally, the transition state barrier for the charge remote side chain cleavage mechanism is predicted to be energetically more favorable than that for charge remote cleavage C-terminal to aspartic acid.   Недавно мы провели статистический анализ одной из "триптиха" пептида тандем масс-спектрометрия базы данных, с тем чтобы определить последовательность в зависимости от модели для газовой фазы фрагментации поведение протонированных пептидов ионов, а также для улучшения модели пептид фрагментации в настоящее время включены в пептид последовательности и базы данных поиск алгоритмов [Каппа, EA, Шутц, F., Рид, GE, Eddes, JS, Мориц, RL, O'Hair, RAJ, Speed, TP и Симпсон, RJ анализ. Хим. 2003, 75, 6251-6264.]. Здесь мы вновь эту базу данных с целью определения влияния общей пост-трансляционного или процесс индуцированной модификации, метионин окисления, на внешний вид и относительная численность этого продукта формируется ионов низкой энергии столкновения индуцированной диссоциации ионов пептид, содержащий эту модификацию . Результаты этого исследования свидетельствуют о том, что в структурном отношении диагностических нейтральной потери метана sulfenic кислоты (CH3SOH, 64Da) со стороны цепи метионина sulfoxide остатков является доминирующим фрагментации процесса метионин sulfoxide содержащие пептид ионов в условиях низкой мобильности протона, то есть, когда ионизирующего протонов (ей), поглощенный в решительно основных аминокислот, таких, как аргинина, лизина и гистидина. Продукт ионов изобилии в результате этого нейтрального потери оказались примерно в 2 раза больше, чем в результате раскол C-терминал к аспарагиновой кислоты, которые ранее уже было показано быть повышена при тех же условиях. В тесном согласие с этими статистическими тенденциями, экспериментальных и теоретических исследований с использованием синтетических "триптиха" пептидов и модель метионин sulfoxide содержащие пептид ионов, установили, что этот механизм для расширения метионин sulfoxide боковой цепи спайности доходов, в первую очередь с помощью "заряда дистанционного процесса. Вместе с тем, механизм диссоциации боковой цепи для этих ионов было отмечено, изменения в зависимости от протона мобильности. Наконец, переход государственной барьером для обвинения дистанционного боковой цепи спайности механизм прогнозам, будет энергично более благоприятные, чем для обвинения дистанционного спайности C-терминал к аспарагиновой кислоты.

к списку статей за 2004 год (en)

в библиотеку