Аргинин.Ру - всё об аргинине  
В начало
Контакты
Рекламодателям
 


молекула L-arginine
молекула L-arginine

Нобелевские лауреаты 1998 года:

Ф.Ферчготт

Л.Игнарро

Ф.Мурад

аргинин по 1000 мг 90 капсул производства Solgar

Про аргинин:

Что такое аргинин?
Откуда берется аргинин?
Механизм действия.

Аргинин в медицине:

Сердечная недостаточн.
Стенокардия
Гипертония
Онкология (рак)
Геронтология (старение)
Атеросклероз
Травмы
Ожоги
Гормональный обмен
ВИЧ/СПИД

Где купить аргинин

аргинин по 1000 мг 90 капсул производства Solgar

Библиотека статей:




Deprecated: Methods with the same name as their class will not be constructors in a future version of PHP; SAPE_base has a deprecated constructor in /home/ih72672/public_html/arginine.ru/1152e72650d4093c1a42c7534a7d7797/sape.php on line 21

Deprecated: Methods with the same name as their class will not be constructors in a future version of PHP; SAPE_client has a deprecated constructor in /home/ih72672/public_html/arginine.ru/1152e72650d4093c1a42c7534a7d7797/sape.php on line 615

Deprecated: Methods with the same name as their class will not be constructors in a future version of PHP; SAPE_context has a deprecated constructor in /home/ih72672/public_html/arginine.ru/1152e72650d4093c1a42c7534a7d7797/sape.php on line 1177

Deprecated: Methods with the same name as their class will not be constructors in a future version of PHP; SAPE_articles has a deprecated constructor in /home/ih72672/public_html/arginine.ru/1152e72650d4093c1a42c7534a7d7797/sape.php on line 1529

Warning: Use of undefined constant _SAPE_USER - assumed '_SAPE_USER' (this will throw an Error in a future version of PHP) in /home/ih72672/public_html/arginine.ru/1152e72650d4093c1a42c7534a7d7797/sape.php on line 1090
Авторы:Barrick JE, Roberts RW.
Дата:2003 год, ноябрь.

Achieving specificity in selected and wild-type N peptide-RNA complexes: the importance of discrimination against noncognate RNA targets.

  автоматический перевод
The boxB RNA pentaloops from the P22 and lambda phages each adopt a GNRA tetraloop fold upon binding their cognate arginine-rich N peptides. The third loop base in P22 boxB (3-out) and the fourth in lambda boxB (4-out) are excluded to accommodate this structure. Previously, we selected a pool of lambda N sequences with random amino acids at loop contacting positions 13-22 for binding to either of these two GNRA-folded pentaloops or a canonical GNRA tetraloop and isolated a class of peptides with a new conserved arginine (R15). Here, we characterize the binding of lambda N and these R15 peptides using fluorescent titrations with 2-aminopurine labeled versions of the three GNRA-folded loops and circular dichroism spectrometry. All peptides preferentially bind the lambda boxB RNA loop. lambda N and R15 peptide specificity against the P22 loop arises from the cost of rearranging its loop into the 4-out GNRA structure. Modeling indicates that the interaction of R8 with an additional loop phosphate in the 4-out GNRA pentaloop selectively stabilizes this complex relative to the tetraloop. R15 peptides gain additional discrimination against the tetraloop because their arginine also preferentially interacts with the 4-out GNRA pentaloop phosphate backbone, whereas K14 and W18 of lambda N contribute equal affinity when binding the tetraloop. Nonspecific electrostatic interactions by basic residues near the C-termini of these peptides create significantly steeper salt dependencies in association constants for noncognate loops, aiding discrimination at high salt concentrations. Our results emphasize the importance of considering specificity against noncognate as well as nonspecific targets in the combinatorial and rational design of biopolymers capable of macromolecular recognition.   В boxB РНК pentaloops от P22 и фагов лямбда каждого принять GNRA tetraloop раз после обязательной их близкими аргинина богатых Н пептидов. Третий цикл базы в P22 boxB (3-выход), а четвертый в лямбда boxB (4-в) не допускается для размещения этой структуры. Ранее мы выбрали пула лямбда Н со случайной последовательности аминокислот в цикле обратиться позиций 13-22 обязательными для какой-либо из этих двух GNRA-кратным pentaloops или канонической GNRA tetraloop и изолированных класс пептидов с новым сохранение аргинина (R15 ). Здесь мы характеризующие связывание лямбда Н R15, и эти пептиды с помощью флуоресцентного titrations с 2-aminopurine помечены версии трех GNRA-кратным петли и круговой dichroism спектрометрии. Все пептидов преимущественно связывают лямбда boxB РНК петля. лямбда Н и R15 пептид специфику против P22 цикла возникает из-за расходов на изменение ее петли на 4-из GNRA структуры. Моделирование показывает, что взаимодействие R8 с дополнительной петли фосфата в 4 из GNRA pentaloop избирательно стабилизирует этой сложной по сравнению с tetraloop. R15 пептидов получения дополнительной дискриминации против tetraloop потому, что их аргинина также преимущественно взаимодействует с 4-из GNRA pentaloop фосфат позвоночника, в то K14 и W18 от лямбда Н способствовать равной близости, когда обязательными tetraloop. Неспецифической электростатического взаимодействия по основным остатков у C-пунктами, эти пептиды создают значительно круче, соли, в зависимости ассоциации константы noncognate петли, пособничество дискриминации при высокой концентрации соли. Наши результаты подчеркивают важность учета специфики против noncognate а также неспецифической цели в комбинаторной и рациональное проектирование биополимеров, способных макромолекулярных признания.

к списку статей за 2003 год (en)

в библиотеку