Аргинин.Ру - всё об аргинине  
В начало
Контакты
Рекламодателям
 


молекула L-arginine
молекула L-arginine

Нобелевские лауреаты 1998 года:

Ф.Ферчготт

Л.Игнарро

Ф.Мурад

аргинин по 1000 мг 90 капсул производства Solgar

Про аргинин:

Что такое аргинин?
Откуда берется аргинин?
Механизм действия.

Аргинин в медицине:

Сердечная недостаточн.
Стенокардия
Гипертония
Онкология (рак)
Геронтология (старение)
Атеросклероз
Травмы
Ожоги
Гормональный обмен
ВИЧ/СПИД

Где купить аргинин

аргинин по 1000 мг 90 капсул производства Solgar

Библиотека статей:




Deprecated: Methods with the same name as their class will not be constructors in a future version of PHP; SAPE_base has a deprecated constructor in /home/ih72672/public_html/arginine.ru/1152e72650d4093c1a42c7534a7d7797/sape.php on line 21

Deprecated: Methods with the same name as their class will not be constructors in a future version of PHP; SAPE_client has a deprecated constructor in /home/ih72672/public_html/arginine.ru/1152e72650d4093c1a42c7534a7d7797/sape.php on line 615

Deprecated: Methods with the same name as their class will not be constructors in a future version of PHP; SAPE_context has a deprecated constructor in /home/ih72672/public_html/arginine.ru/1152e72650d4093c1a42c7534a7d7797/sape.php on line 1177

Deprecated: Methods with the same name as their class will not be constructors in a future version of PHP; SAPE_articles has a deprecated constructor in /home/ih72672/public_html/arginine.ru/1152e72650d4093c1a42c7534a7d7797/sape.php on line 1529

Warning: Use of undefined constant _SAPE_USER - assumed '_SAPE_USER' (this will throw an Error in a future version of PHP) in /home/ih72672/public_html/arginine.ru/1152e72650d4093c1a42c7534a7d7797/sape.php on line 1090
Авторы:Hashimoto W, Nankai H, Mikami B, Murata K.
Дата:2002 год, декабрь.

Crystal structure of Bacillus sp. GL1 xanthan lyase, which acts on the side chains of xanthan.

  автоматический перевод
Xanthan lyase, a member of polysaccharide lyase family 8, is a key enzyme for complete depolymerization of a bacterial heteropolysaccharide, xanthan, in Bacillus sp. GL1. The enzyme acts exolytically on the side chains of the polysaccharide. The x-ray crystallographic structure of xanthan lyase was determined by the multiple isomorphous replacement method. The crystal structures of xanthan lyase and its complex with the product (pyruvylated mannose) were refined at 2.3 and 2.4 A resolution with final R-factors of 17.5 and 16.9%, respectively. The refined structure of the product-free enzyme comprises 752 amino acid residues, 248 water molecules, and one calcium ion. The enzyme consists of N-terminal alpha-helical and C-terminal beta-sheet domains, which constitute incomplete alpha(5)/alpha(5)-barrel and anti-parallel beta-sheet structures, respectively. A deep cleft is located in the N-terminal alpha-helical domain facing the interface between the two domains. Although the overall structure of the enzyme is basically the same as that of the family 8 lyases for hyaluronate and chondroitin AC, significant differences were observed in the loop structure over the cleft. The crystal structure of the xanthan lyase complexed with pyruvylated mannose indicates that the sugar-binding site is located in the deep cleft, where aromatic and positively charged amino acid residues are involved in the binding. The Arg(313) and Tyr(315) residues in the loop from the N-terminal domain and the Arg(612) residue in the loop from the C-terminal domain directly bind to the pyruvate moiety of the product through the formation of hydrogen bonds, thus determining the substrate specificity of the enzyme.   Ксантановая lyase, член полисахаридов lyase семьи 8, является одним из ключевых ферментов для полной деполимеризации в бактериальных heteropolysaccharide, xanthan, в Bacillus экз. GL1. Фермент актов exolytically на стороне сети из полисахаридов. В рентгеновских кристаллографических структуры xanthan lyase было обусловлено несколькими isomorphous замена метода. Хрустальная структур xanthan lyase и его комплекса с продуктом (pyruvylated маннозы) были уточнены на уровне 2,3 и 2,4 В резолюции, в окончательном R-факторы 17,5 и 16,9%, соответственно. Уточненный структура продукта-бесплатно фермента состоит из 752 аминокислотных остатков, 248 молекул воды, и один ионов кальция. Фермент состоит из N-терминал альфа-спиральных и С-терминал бета-листов доменов, которые являются неполными альфа (5) / альфа (5)-ствол и анти-параллельно бета-лист структур, соответственно. Глубокий cleft находится в N-терминал альфа-спиральных доменов, стоящих между двумя доменами. Хотя в общей структуре фермента, в основном те же, что и семьи 8 lyases для hyaluronate и хондроитин AC, существенные различия были отмечены в петлю структуры над cleft. В кристаллической структуры на xanthan lyase связанный с pyruvylated маннозы свидетельствует о том, что сахар-обязательный сайт находится в глубокой cleft, где ароматических и положительно заряженных аминокислотных остатков участвуют в обязательный. В Арг (313) и Tyr (315) остатки в петлю из N-терминал достоянием, и Арг (612) остатков в петлю из C-терминал домен напрямую связывать с pyruvate moiety этого продукта за счет формирования водородных облигаций, таким образом, определить субстрат специфичности фермента.

к списку статей за 2002 год (en)

в библиотеку