Аргинин.Ру - всё об аргинине  
В начало
Контакты
Рекламодателям
 


молекула L-arginine
молекула L-arginine

Нобелевские лауреаты 1998 года:

Ф.Ферчготт

Л.Игнарро

Ф.Мурад

аргинин по 1000 мг 90 капсул производства Solgar

Про аргинин:

Что такое аргинин?
Откуда берется аргинин?
Механизм действия.

Аргинин в медицине:

Сердечная недостаточн.
Стенокардия
Гипертония
Онкология (рак)
Геронтология (старение)
Атеросклероз
Травмы
Ожоги
Гормональный обмен
ВИЧ/СПИД

Где купить аргинин

аргинин по 1000 мг 90 капсул производства Solgar

Библиотека статей:




Deprecated: Methods with the same name as their class will not be constructors in a future version of PHP; SAPE_base has a deprecated constructor in /home/ih72672/public_html/arginine.ru/1152e72650d4093c1a42c7534a7d7797/sape.php on line 21

Deprecated: Methods with the same name as their class will not be constructors in a future version of PHP; SAPE_client has a deprecated constructor in /home/ih72672/public_html/arginine.ru/1152e72650d4093c1a42c7534a7d7797/sape.php on line 615

Deprecated: Methods with the same name as their class will not be constructors in a future version of PHP; SAPE_context has a deprecated constructor in /home/ih72672/public_html/arginine.ru/1152e72650d4093c1a42c7534a7d7797/sape.php on line 1177

Deprecated: Methods with the same name as their class will not be constructors in a future version of PHP; SAPE_articles has a deprecated constructor in /home/ih72672/public_html/arginine.ru/1152e72650d4093c1a42c7534a7d7797/sape.php on line 1529

Warning: Use of undefined constant _SAPE_USER - assumed '_SAPE_USER' (this will throw an Error in a future version of PHP) in /home/ih72672/public_html/arginine.ru/1152e72650d4093c1a42c7534a7d7797/sape.php on line 1090
Авторы:Katsamba PS, Bayramyan M, Haworth IS, Myszka DG, Laird-Offringa IA.
Дата:2002 год, июнь.

Complex role of the beta 2-beta 3 loop in the interaction of U1A with U1 hairpin II RNA.

  автоматический перевод
RNA recognition motifs (RRMs) are characterized by highly conserved regions located centrally on a beta-sheet, which forms the RNA binding surface. Variable flanking regions, such as the loop connecting beta-strands 2 and 3, are thought to be important in determining the RNA-binding specificities of individual RRMs. The N-terminal RRM of the spliceosomal U1A protein mediates binding to an RNA hairpin (U1hpII) in the U1 small nuclear RNA. In this complex, the beta(2)-beta(3) loop protrudes through the 10-nucleotide RNA loop. Shortening of the RNA loop strongly perturbs binding, suggesting that an optimal "fit" of the beta(2)-beta(3) loop into the RNA loop is an important factor in complexation. To understand this interaction further, we mutated or deleted loop residues Lys(50) and Met(51), which protrude centrally into the RNA loop but do not make any direct contacts to the bases. Using BIACORE, we analyzed the ability of these U1A mutants to bind to wild type RNAs, or RNAs with shortened loops. Alanine replacement mutations only modestly affected binding to wild type U1hpII. Interestingly, simultaneous replacement of Lys(50) and Met(51) with alanine appeared to alleviate the loss of binding caused by shortening of the RNA loop. Deletion of Lys(50) or Met(51) caused a dramatic loss in stability of the U1A.U1hpII complex. However, deletion of both residues simultaneously was much less deleterious. Simulated annealing molecular dynamics analyses suggest this is due to the ability of this mutant to rearrange flanking amino acids to substitute for the two deleted residues. The double deletion mutant also exhibited substantially reduced negative effects of RNA loop shortening, suggesting the rearranged loop is better able to accommodate a short RNA loop. Our results indicate that one of the roles of the beta(2)-beta(3) loop is to provide a steric fit into the RNA loop, thereby stabilizing the RNA.protein complex.   РНК признание мотивы (RRMs), характеризуются высокой сохранение регионов, расположенных в централизованном порядке на бета-лист, который образует РНК обязательного поверхности. Переменная фланкирующими регионах, таких как петли соединения бета-нити 2 и 3, считается, что на их важную роль в определении РНК-обязательные особенностей отдельных RRMs. В N-терминал RRM из spliceosomal U1A белка посредника обязательными к РНК-шпильки (U1hpII) в U1 малых ядерных РНК. В этом комплексе, в бета-версии (2)-бета (3) петли protrudes через 10-нуклеотидов РНК петля. Укорачивание РНК петля сильно смущает обязательными, что свидетельствует о том, что оптимальный "соответствуют" в бета-версии (2)-бета (3) петли на РНК петля является важным фактором в комплексообразования. Чтобы понять это взаимодействие еще, мы переросли или исключить петли остатки Лис (50) и ИМ (51), которые выступают в централизованном порядке в РНК петля, но не делают никаких прямых контактов с баз. Использование BIACORE, мы проанализировали способность этих U1A мутантов связываться с дикого типа RNAs, или RNAs сокращен с петель. Аланин замены мутации лишь незначительно пострадавших обязательными для дикого типа U1hpII. Интересно, что одновременно замену Лис (50) и ИМ (51) с аланин-видимому, смягчить потери, вызванные обязательным сокращение РНК петля. Исключение Лис (50) или ИМ (51) привели к трагической гибелью в стабильности в U1A.U1hpII комплекса. Вместе с тем, исключение, так остатков одновременно был гораздо менее вредное. Имитация отжига молекулярной динамики анализов свидетельствуют это связано со способностью этого мутанта, чтобы изменить сопутствующих аминокислот для замены двух удалены остатки. Двойное исключение мутанта также выставлены значительно сократить негативные последствия сокращения цикла РНК, что свидетельствует о переставить петли имеет более широкие возможности для размещения коротких РНК петля. Наши результаты свидетельствуют о том, что одну из ролей в бета-версии (2)-бета (3) петля является обеспечение steric вписываются в РНК петля, тем самым стабилизации RNA.protein комплекса.

к списку статей за 2002 год (en)

в библиотеку