Аргинин.Ру - всё об аргинине  
В начало
Контакты
Рекламодателям
 


молекула L-arginine
молекула L-arginine

Нобелевские лауреаты 1998 года:

Ф.Ферчготт

Л.Игнарро

Ф.Мурад

аргинин по 1000 мг 90 капсул производства Solgar

Про аргинин:

Что такое аргинин?
Откуда берется аргинин?
Механизм действия.

Аргинин в медицине:

Сердечная недостаточн.
Стенокардия
Гипертония
Онкология (рак)
Геронтология (старение)
Атеросклероз
Травмы
Ожоги
Гормональный обмен
ВИЧ/СПИД

Где купить аргинин

аргинин по 1000 мг 90 капсул производства Solgar

Библиотека статей:




Deprecated: Methods with the same name as their class will not be constructors in a future version of PHP; SAPE_base has a deprecated constructor in /home/ih72672/public_html/arginine.ru/1152e72650d4093c1a42c7534a7d7797/sape.php on line 21

Deprecated: Methods with the same name as their class will not be constructors in a future version of PHP; SAPE_client has a deprecated constructor in /home/ih72672/public_html/arginine.ru/1152e72650d4093c1a42c7534a7d7797/sape.php on line 615

Deprecated: Methods with the same name as their class will not be constructors in a future version of PHP; SAPE_context has a deprecated constructor in /home/ih72672/public_html/arginine.ru/1152e72650d4093c1a42c7534a7d7797/sape.php on line 1177

Deprecated: Methods with the same name as their class will not be constructors in a future version of PHP; SAPE_articles has a deprecated constructor in /home/ih72672/public_html/arginine.ru/1152e72650d4093c1a42c7534a7d7797/sape.php on line 1529

Warning: Use of undefined constant _SAPE_USER - assumed '_SAPE_USER' (this will throw an Error in a future version of PHP) in /home/ih72672/public_html/arginine.ru/1152e72650d4093c1a42c7534a7d7797/sape.php on line 1090
Авторы:Rooman M, Lie'vin J, Buisine E, Wintjens R.
Дата:2002 год, май.

Cation-pi/H-bond stair motifs at protein-DNA interfaces.

  автоматический перевод
H-bonds and cation-pi interactions between nucleic acid bases and amino acid side-chains are known to occur often concomitantly at the interface between protein and double-stranded DNA. Here we define and analyze stair-shaped motifs, which simultaneously involve base stacking, H-bond and cation-pi interactions. They consist of two successive bases along the DNA stack, one in cation-pi interaction with an amino acid side-chain that carries a total or partial positive charge, and the other H-bonded with the same side-chain. A survey of 52 high-resolution structures of protein/DNA complexes reveals the occurrence of such motifs in the majority of the complexes, the most frequent of these motifs involving Arg side-chains and G bases. These stair motifs are sometimes part of larger motifs, called multiple stair motifs, which contain several successive stairs; zinc finger proteins for example exhibit up to quadruple stairs. In another kind of stair motif extension, termed cation-pi chain motif, an amino acid side-chain or a nucleic acid base forms simultaneously two cation-pi interactions. Such a motif is observed in several homeodomains, where it involves a DNA base in cation-pi interactions with an Arg in the minor groove and an Asn in the major groove. A different cation-pi chain motif contains an Arg in cation-pi with a G and a Tyr, and is found in ets transcription factors. Still another chain motif is encountered in proteins that expulse a base from the DNA stack and replace it by an amino acid side-chain carrying a net or partial positive charge, which forms cation-pi interactions with the two neighboring bases along the DNA strand. The striking conservation of typical stair and cation-pi chain motifs within families of protein/DNA complexes suggests that they might play a structural and/or functional role and might moreover influence electron migration through the DNA double helix.   H-облигации и катионов-pi взаимодействия нуклеиновых кислот баз и аминокислоты боковых цепей, как известно, часто происходят одновременно на стыке белка и дважды мель ДНК. Здесь мы определяем и анализируем лестниц-образных мотивов, которые одновременно привлекать базы складирования, H-облигаций и катионов-pi взаимодействий. Они состоят из двух баз вдоль ДНК стек, один в катионов-pi взаимодействие с аминокислотой сторона цепи, что влечет за собой полное или частичное положительный заряд, а другой H-подневольный с одной и той же стороне цепи. Обследование 52 с высоким разрешением структуры белок / ДНК комплексов свидетельствует появление таких мотивов в большинство комплексов, наиболее частыми из этих мотивов, связанных с Арг боковых цепей и Г баз. Эти лестницы мотивы иногда частью более крупных мотивов, называется несколько лестничных мотивов, которые содержат несколько последовательных лестнице; цинковых пальцев белков например, выставку в четыре раза до лестницы. В другой вид лестничной мотив расширения, назвал катионов-pi цепи мотив, одна аминокислота стороне цепи или нуклеиновые кислоты базовых форм одновременно два катиона-pi взаимодействий. Такой мотив наблюдается в нескольких homeodomains, где он связан с ДНК базы в катионов-pi взаимодействия с Арг в незначительных канавку и Asn в крупных канавку. Иной катионов-pi цепи мотив содержит Арг в катионов-pi с ОО и Тире, и находится в т. факторы транскрипции. Еще одна цепь мотив встречается в белках, что expulse базы ДНК стека и заменить его на один аминокислот боковой цепочки с чистой или частичный положительный заряд, который образует катионов-pi взаимодействия с двух соседних баз вдоль ДНК пряди. В поразительным сохранения типичных лестниц и катионов-pi цепи мотивов в семьях белка / ДНК комплексов свидетельствует о том, что они могут играть структурной и / или функциональной роли и, возможно, более того влияния миграции электронов через двойной спирали ДНК.

к списку статей за 2002 год (en)

в библиотеку