Аргинин.Ру - всё об аргинине  
В начало
Контакты
Рекламодателям
 


молекула L-arginine
молекула L-arginine

Нобелевские лауреаты 1998 года:

Ф.Ферчготт

Л.Игнарро

Ф.Мурад

аргинин по 1000 мг 90 капсул производства Solgar

Про аргинин:

Что такое аргинин?
Откуда берется аргинин?
Механизм действия.

Аргинин в медицине:

Сердечная недостаточн.
Стенокардия
Гипертония
Онкология (рак)
Геронтология (старение)
Атеросклероз
Травмы
Ожоги
Гормональный обмен
ВИЧ/СПИД

Где купить аргинин

аргинин по 1000 мг 90 капсул производства Solgar

Библиотека статей:




Deprecated: Methods with the same name as their class will not be constructors in a future version of PHP; SAPE_base has a deprecated constructor in /home/ih72672/public_html/arginine.ru/1152e72650d4093c1a42c7534a7d7797/sape.php on line 21

Deprecated: Methods with the same name as their class will not be constructors in a future version of PHP; SAPE_client has a deprecated constructor in /home/ih72672/public_html/arginine.ru/1152e72650d4093c1a42c7534a7d7797/sape.php on line 615

Deprecated: Methods with the same name as their class will not be constructors in a future version of PHP; SAPE_context has a deprecated constructor in /home/ih72672/public_html/arginine.ru/1152e72650d4093c1a42c7534a7d7797/sape.php on line 1177

Deprecated: Methods with the same name as their class will not be constructors in a future version of PHP; SAPE_articles has a deprecated constructor in /home/ih72672/public_html/arginine.ru/1152e72650d4093c1a42c7534a7d7797/sape.php on line 1529

Warning: Use of undefined constant _SAPE_USER - assumed '_SAPE_USER' (this will throw an Error in a future version of PHP) in /home/ih72672/public_html/arginine.ru/1152e72650d4093c1a42c7534a7d7797/sape.php on line 1090
Авторы:Zhang DL, Sun XJ, Ling LJ, Chen RS, Ma DL.
Дата:2002 год, май.

Molecular cloning, characterization, chromosomal assignment, genomic organization and verification of SFRS12(SRrp508), a novel member of human SR protein superfamily and a human homolog of rat SRrp86

  автоматический перевод
We have identified and characterized a novel human serine-arginine-rich (SR) splicing regulatory protein 508 (SRrp508) gene that is related to other members of the growing SR superfamily, but only homologous to rat (Rattus norvegicus) serine-arginine-rich splicing regulatory protein 86 (SRrp86) gene. The full-length cDNA of 3811 bp for human SRrp508 was cloned through a blast search of public databases following the identification of a cDNA contig of 658 bp obtained by EST assembly with full robotization in supercomputer in large-scale. Structurally, human SRrp508 encodes a polypeptide of 508 amino acids, which contains a single amino-terminal RNA recognition motif (RRM) and two carboxy-terminal domains rich in serine-arginine dipeptides that are highly conserved among other members of the SR superfamily. The conserved SR and RRM domains emphasize the biological importance of this gene. The SRrp508 gene, which contains 12 exons ranging from 0.096 to 2.093 kb and 11 introns ranging from 0.14 to 5.153 kb, is mapped to the human cytogenetic region 5q11.2-q12.1 using the bioinformatic analysis, and it does not link to any other genes. Furthermore, we have experimentally cloned and sequenced a cDNA fragment of 1680 bp containing the full-length ORF of 1527 bp in this novel human gene by RT-PCR from the single-stranded human pancreas cDNA library (Clontech), which is fully identical with that of the in silico cloning determined by the nucleotide sequencing. Thus, we in silico cloned his gene with GenBank accession number of AF459094 identified solely by bioinformatic analysis of the nucleotide and protein. This novel gene has promotors, TATA-box, several stop codons in the upstream of ORF, and PolyA signal in the downstream of ORF. Based on the above results, it can be concluded that we have obtained a complete novel human gene. The gene sequence exhibits good overall homology to that of rat SRrp86 gene, with 84% and 86% identity over the full-length nucleotide and protein, respectively, and with 96% and 86% identity over the serine-rich domain (RS) or arginine-rich domain (RA), respectively. The full-length sequence exhibits little overall homology to any other known protein at either the nucleotide or the amino acid level. The other two most closely related proteins, with 34% and 35% identity over the full-length protein, respectively, or with 51% and 54% identity over the full-length nucleotide of ORF, respectively, are drosophila serine-arginine-rich protein 54 (SRp54) and human arginine-rich nuclear protein 54 (p54). When comparisons are restricted to the RS or RA domains, the percent identity increased for both SRp54 and p54 are 44% and 54% or 38% and 43%, respectively. These results well demonstrate that only the novel human protein of 508 amino acids cloned is the human homolog of rat SRrp86, thus correcting the standpoint made by Barnard and Patton (Barnard DC, Patton JG. Identification and Characterization of a Novel Serine-Arginine-Rich Splicing Regulatory Protein. Molecular and Cellular Biology, 2000, 20(9): 3049-3057) that human arginine-rich nuclear protein 54 (p54) is the human homolog of the rat SRrp86, and suggesting that human SRrp508 is a new member of this growing superfamily of SR proteins. SRrp508 has an extensive expression profile, and may be a transcriptional factor. On the basis of its sequence and functional properties, we have named this protein SRrp508 for SR-related splicing regulatory protein of 508 amino acids. In summary, by combining bioinformatic analysis with experimental verification, we have successfully cloned the human cDNA homolog of rat SRrp86, which is verified by a series of theoretical and experimental evidence. The HGNC has just given SRrp508 gene entry the nomenclature information containing APPROVED SYMBOL: SFRS12; NAME: splicing factor, arginine/serine-rich 12; and ALIAS: DKFZp564B176, SRrp86. We have cloned this gene for near one year with no person landing the GenBank for registering the same gene. Our newly-established technique line will be helpful in discovering much more novel human genes.   Мы выявили и охарактеризовали роман человеческой серин-аргинина-богатые (SR) сплайсинга регулирования белка 508 (SRrp508) гена, который связан с другими членами растущей SR надсемейства, но только гомологичные крысы (Rattus norvegicus) серин-аргинина богатых сплайсинга регулирования белок 86 (SRrp86) ген. Полная длина cDNA в 3811 п.н. для человека SRrp508 был клонирован путем взрыва поиск государственных баз данных после идентификации в cDNA contig из 658 п.н., полученные EST собраний с полной роботизации в суперкомпьютер в крупном масштабе. Структурно, прав SRrp508 кодирует один полипептидный из 508 аминокислот, который содержит единственный амино-терминал РНК признание мотив (МБР) и два карбокси-терминал домены богаты серин-аргинина dipeptides, что в значительной степени сохраняется среди других членов Совета SR надсемейства. На сохранение и SR RRM домены подчеркнуть биологическую значимость этого гена. В SRrp508 гена, который содержит 12 экзонов, начиная от 0,096 до 2,093 кб и 11 интроны, начиная от 0,14 до 5,153 кб, это отображается на человека цитогенетические региона 5q11.2-q12.1 использованием bioinformatic анализа, а не ссылку на любое других генов. Кроме того, мы экспериментально клонированы и секвенированы один cDNA фрагмент 1680 п.н., содержащий полный текст ORF в 1527 п.н. в этом романе человеческого гена в РТ-ПЦР из одного человека мель поджелудочной железы cDNA библиотека (Clontech), который полностью совпадает с , что из в silico клонирования зависит от последовательности нуклеотидов. Таким образом, мы, в свою silico клонированный ген с GenBank присоединения число AF459094 определены исключительно bioinformatic анализ нуклеотидных и белковых. Этот роман ген имеет promotors, TATA-бокс, несколько остановить codons в верховий ORF, а PolyA сигнал в нижнем течении ORF. Исходя из выше результаты, можно сделать вывод о том, что мы получили полное роман человеческого гена. В последовательности генов экспонатов хорошей гомологии, что и крысы SRrp86 гена, 84% и 86% личности над полнометражного нуклеотидов и белков, соответственно, и с 96% и 86% личности над серин-богатых домена (РС), или аргинина-богатых домена (РА), соответственно. Полная длина последовательности экспонатов мало общего гомологии любых других известных белков ни на нуклеотидов или аминокислот уровне. Два других, наиболее тесно связанных с белками, с 34% и 35% личности над полнометражного белка, соответственно, или с 51% и 54% личности над полнометражного нуклеотидов из ORF, соответственно, дрозофил серин-аргинина богатых белок 54 (SRp54) и человеческого аргинина богатых ядерного белка 54 (p54). После сопоставления ограничены РС или РА доменов, процент идентичности увеличился на обоих SRp54 и p54 являются 44% и 54% или 38% и 43%, соответственно. Эти результаты также показывают, что только роман человеческого белка из 508 аминокислот является клонированного человеческого homolog крыс SRrp86, таким образом, с точки зрения исправления, сделанные Барнард и Паттон (Барнард DC, Паттон JG. Выявление и характеристика один роман Серине-Аргинин-Rich Сплисинг регулирования белка. Молекулярной биологии и сотовых, 2000, 20 (9): 3049-3057), что права аргинина богатых ядерного белка 54 (p54) является человек homolog из SRrp86 крысы, и о том, что человека SRrp508 является новым членом этой растущей надсемейства СИ белков. SRrp508 имеет обширную выражения профиля, а также может быть фактором транскрипции. На основе ее последовательность и функциональных свойств, мы назвали этот белок SRrp508 для SR связанных сплайсинга регулирования белка из 508 аминокислот. В итоге, путем объединения bioinformatic анализ в экспериментальной проверке, мы успешно клонированного человеческого cDNA homolog крыс SRrp86, который проверен ряд теоретических и экспериментальных доказательств. В HGNC только что SRrp508 гена вступления номенклатуры информации, содержащей УТВЕРЖДЕНА ОБОЗНАЧЕНИЯ: SFRS12; NAME: сварочные фактором, аргинина / серин богатых 12, и ALIAS: DKFZp564B176, SRrp86. Мы клонировали этого гена вблизи одного года без каких-либо лицо посадке GenBank для регистрации того же гена. Наши вновь созданной техники линия будет полезным для обнаружения гораздо больше новых генов человека.

к списку статей за 2002 год (en)

в библиотеку